（一）辦公室。負責機關日常運轉，承擔政務協調和行政事務管理工作，承擔新聞宣傳、政務信息、機要保密、文書檔案、督促檢查等工作；承擔重要文件和綜合性文稿起草；負責系統重點工作督辦和目標責任制考核；負責機關及所屬單位的干部人事、機構編制、勞動工資等工作；負責機關及所屬單位人員出國（境）管理；指導協調所屬單位的改革、改制工作；負責離退休干部工作。
（二）宣傳教育和監察科。負責局系統黨建和黨風廉政建設工作；負責系統思想政治、作風建設、理論宣傳、教育培訓等工作，承擔局系統業內監察工作；負責系統評先評優管理工作；負責精神文明建設和文明行業創建等工作；負責日常考核、年度考核等工作；負責局系統統戰工作、雙擁工作、結對共建、工會、共青團、婦工委工作。
（三）財務審計科。負責編制機關經費預決算，審核經費支出；配合有關部門管理和審計監督住房和城鄉建設領域公共資金；負責住房和城鄉建設綜合統計工作，匯總上報高質量發展指標體系涉建監測指標；配合相關部門管理住房和城鄉建設行業產品價格；負責機關各項資金和國有資產的管理和使用，征收和管理住房和城鄉建設行業非稅收入；監督所屬單位的財務和國有資產的管理；負責機關及所屬單位的內部審計工作。
（四）法制科（行政服務科、監管協調科）。承擔信訪和政務公開工作，負責信息化管理工作；承擔規范性文件合法性審查、信息公開答復法制審核工作；承擔全市住房和城鄉建設行政執法監督、法制宣傳教育工作；承辦行政復議和行政應訴案件；負責推進住房和城鄉建設信用體系建設工作。負責本部門行政審批和服務事項的辦理，并限時辦結；組織指導推進全市住房和城鄉建設“放管服”改革工作；負責做好與市行政審批局的工作銜接；負責事中事后監管事項的牽頭、匯總和評價工作；牽頭“雙隨機、一公開”監管工作。
（五）住房保障和物業管理科。組織編制全市住房發展規劃和住房保障發展規劃、年度計劃并組織實施；擬訂住房保障制度規定，推進住房制度改革并組織實施；推進全市住房保障體系建設和保障性安居工程建設；負責全市保障性住房建設和管理，推進棚戶區（危舊房）改造；負責全市住房保障資金、住房專項資金的監督管理；負責會同相關部門落實中央和省保障性安居工程資金安排的有關事項，配合有關部門對保障性安居工程進行的融資、審計和資金清算等方面工作。組織擬訂物業管理政策措施和行業標準并監督實施；負責物業服務人員的業務培訓；負責物業服務行業的信用體系建設；參與協調物業管理的矛盾糾紛；指導監督住宅專項維修資金管理工作和前期物業管理招投標活動；指導物業服務企業對住宅裝飾裝修行為進行監督管理；牽頭擬訂城鎮房屋安全管理規定，組織推進市區危房解危；指導各鎮（園區、街道）物業管理和既有房屋安全管理工作。擬訂房屋征收與補償政策文件并組織實施；牽頭編制全市房屋征收規劃和年度計劃并監督實施；負責全市房屋征收部門、房屋征收實施單位、征收服務機構、征收評估機構人員的業務培訓和征收服務機構、征收評估機構的準入管理工作；指導監督各鎮園區房屋征收矛盾糾紛調處工作；承擔由市政府作出房屋征收決定的相關工作。
（六）房地產市場監管科。擬訂全市房地產行業發展規劃并組織實施；擬訂房地產開發、住宅產業化與性能認定、房地產交易與產權管理、房屋租賃、房屋面積管理、房地產估價與經紀管理等相關政策和管理制度并監督執行；負責房地產開發企業的資質監管；承擔房地產市場監督管理職責；負責研究落實房地產市場調控的政策措施，建立房地產市場監測體系，承擔全市房地產市場調控工作。
（七）城市建設管理科。牽頭推進海綿城市建設；負責編制本級市政工程年度建設計劃并監督實施，參與編制城市建設中長期規劃；負責本級市政工程建設項目的協調、推進和督促工作；推廣應用市政行業技術規范和行業標準；負責市區市政優質工程的推薦申報工作；承擔市區道路（橋梁）、照明（亮化）行業管理工作；擬定市區道路（橋梁）、照明（亮化）行業的管理制度和辦法并監督實施；擬訂市區地下管線管理的制度和辦法并監督實施；擬訂市區地下管線年度建設計劃并組織實施，會同有關部門編制市區地下管線綜合規劃和專項計劃；負責市區地下管線施工過程的監督和技術支持；負責市區地下管線運行維護過程中的日常巡查和督查反饋；負責市區地下管線信息系統的建設和維護；組織推進城市地下綜合管廊建設工作；負責市區道路（橋梁）建設工作。承擔文明城市創建相關工作；負責編制市區道路（橋梁）、照明（亮化）的專項規劃；負責市區道路（橋梁）的管理、養護工作；負責市區照明（亮化）的建設、管理和養護工作；牽頭編制市區道路（橋梁）、照明（亮化）大中修工程計劃并組織實施；負責市區道路（橋梁）、照明（亮化）突發公共事件的應急管理工作；參與編制市區道路（橋梁）、照明（亮化）的建設計劃。
（八）村鎮建設管理科。貫徹建制鎮、集鎮和村莊建設政策，協調村鎮建設相關工作；組織編制全市村鎮建設發展規劃，指導村鎮建設規劃的編制和實施，參與全市村鎮規劃的論證、審查工作；指導農村住房建設、農村住房安全和危房改造工作；擬訂小城鎮和村莊建設政策并指導實施；指導村鎮基礎設施建設、管理與人居環境的改善工作；組織村鎮建筑設計與村鎮建設適用技術的研究和推廣工作；組織村鎮建設試點示范；指導和牽頭推進美麗宜居鄉村建設工程、特色田園鄉村、重點中心鎮和特色小城鎮的建設；指導全市傳統村落保護和發展的監督管理工作；承擔村鎮建設統計工作。承擔全市城鎮燃氣（天然氣、液化石油氣）行業管理工作；負責編制城鎮燃氣（天然氣、液化石油氣）專項規劃并監督實施；負責編制城鎮燃氣事故應急預案、應急保供預案，參與燃氣事故調查處理工作；負責開展燃氣供求狀況監測、預測和預警工作；負責管道燃氣特許經營管理和中期評估工作；牽頭燃氣經營許可、供應許可的監督管理；牽頭組織開展燃氣經營、燃氣使用安全檢查工作。
（九）公共事業管理科。負責全市污水行業管理、行業管理平臺建設及指導城鎮污水處理工作；指導城市排水防澇工作，負責城區排水防澇工作。承擔城鎮供水、排水行業管理工作；擬訂全市城鎮供水、排水行業的管理制度和辦法并監督實施；負責編制城鎮供水、排水行業的專項規劃、年度計劃并監督實施；負責城鎮供水、污水處理特許經營的管理工作；負責城鎮供水、污水處理服務的考核和相關財政補助資金結算等工作；負責城鎮供水水質的監督管理工作；負責排水許可的監督管理；負責城市建成區黑臭水體整治工作；負責城鎮供水、城市排水突發公共事件的應急管理工作；參與城鎮供水、污水處理建設項目可行性論證、方案審查、初步設計會審工作；參與水價調整與污水處理費征收工作；參與河長制相關工作。負責編制城市園林綠化年度建設計劃并監督實施，參與編制城市綠地系統規劃；推廣城市園林綠化建設相關技術規范和行業標準；負責城市園林綠化建設市場信用管理工作；負責城市園林綠化優質工程的推薦申報工作；參與城市綠線的劃定；參與園林綠化工程方案審查、初步設計會審；參與附屬綠化工程設計方案審查和竣工備案工作。負責城市園林綠化行業管理；擬訂全市城市園林綠化行業發展規劃、政策、技術規范并組織實施；負責城市規劃區內的綠地系統構建、生物多樣性及古樹名木保護與管理工作；負責編制城市綠化養護的質量等級、養護定額并監督實施，組織編制城市園林綠化年度維護計劃、資金計劃并監督實施；負責城市園林綠化養護市場信用管理工作；負責城市公園建設、評價定級和運營管理工作；負責市區園林綠化管理考核工作；指導全市園林綠化建設工作；負責“園林城市”“生態園林城市”創建工作；指導城市園林綠化建管交接工作；指導園事花事、市樹市花、立體綠化等推廣普及工作。擬訂供排水和園林綠化工程質量、安全生產的規章制度并監督實施；負責供排水和園林綠化工程質量安全管理工作；指導供排水和園林綠化工程安全施工備案，督促開展施工現場安全生產標準化考評工作；指導供排水和園林綠化行業的質量安全管理工作；參與供排水和園林綠化工程質量、安全事故的調查處理。
（十）建筑市場監管科（防震減災管理科）。擬訂工程勘察設計咨詢業發展規劃、技術政策和規章制度并監督實施；負責勘察設計行業和從業人員管理；指導城市設計、建筑設計、工程勘察設計工作；會同有關部門開展城市有機更新、城市雙修和歷史文化名鎮（村）的申報、保護、管理等工作；監督管理施工圖設計（含消防設計、人防設計、防雷設施設計等）審查工作；承擔江蘇省優秀勘查設計項目、江蘇省設計大師的申報工作。貫徹實施綠色建筑、智慧建筑和建筑節能的政策、規劃；組織實施重大綠色建筑與建筑節能項目；指導建筑能效測評和綠色建筑標識管理工作；會同有關部門開展全市機關辦公建筑和大型公共建筑建筑節能評估的監督管理工作；擬訂住房和城鄉建設科技發展規劃和政策并組織實施，開展建筑行業科技項目研究；制定智慧建筑和建筑產業現代化政策措施并指導實施；推進科技成果的轉化推廣工作；貫徹工程建設標準和標準設計。實施墻材革新和建筑節能產業政策、產品目錄；指導全市墻體材料生產、使用的監督管理；引導墻材行業向裝配式建筑材料轉型升級，負責開展新型墻體材料和散裝水泥技術推廣應用、產品認定；推進城鄉“禁粘”工作；負責全市瀝青混凝土、水泥混凝土和預拌砂漿等生產企業的備案和質量監管；負責全市建筑材料檢測管理。擬訂房屋建筑和市政工程、人民防空工程質量管理的規章制度并監督執行；監督房屋建筑和市政工程、人民防空工程、消防工程的竣工驗收工作；貫徹執行建筑業質量方面的技術政策；負責建筑業的質量管理工作，推進建筑施工技術革新，承擔國家級、省級工法的推薦；參與全市一般等級以上房屋建筑和市政工程、人防工程施工質量、安全事故的調查處理；審核推薦國家級、省級、南通市級優質工程；負責城市地鐵、軌道交通建設階段的質量、安全監管工作；擬訂房屋建筑和市政工程安全生產的規章制度并監督執行；貫徹執行建筑業安全方面的技術政策；負責建筑業的安全管理工作，開展施工現場安全生產標準化考評工作；牽頭局系統安全生產和應急管理工作。組織編制城鄉建設抗震防災、防震減災規劃并指導實施；負責各類房屋建筑及其附屬設施和市政設施抗震設防監督管理；組織開展全市建設工程的抗震加固、抗震鑒定和使用管理；指導全市應急避難場所建設；參與地震現場調查和震害評估工作，組織震后建設工程的應急評估；負責全市地震監測預報管理；編制全市地震監測臺網（站）建設發展規劃并監督實施；負責地震監測設施和地震觀測環境保護工作；組織開展全市地震群測群防工作，調查核實地震前兆異常；落實震情會商制度，組織編制地震趨勢研究報告；擬訂市級地震應急預案，建立地震應急預案管理和備案制度，指導和督促有關部門和單位制定地震應急預案；承擔市防震減災聯席會議辦公室的日常工作。擬訂規范建筑市場主體及中介服務機構行為的規章制度并監督執行；負責建筑工程和市政基礎設施工程項目招投標活動和合同備案的監督管理；負責工程建設實施階段的監督管理，指導工程項目建設、合同管理和工程風險管理；負責全市建設市場信用體系的建設和管理；指導全市涉外建設項目的管理；負責建筑市場信息化建設和管理。
（十一）建筑行業管理科。指導住房和城鄉建設各行業的人才培養和職業教育工作；組織建設工程系列職稱的申報；負責建筑行業的能力培訓、繼續教育、執業資格管理工作。擬訂全市建筑業發展規劃、政策并監督執行；負責全市建筑業企業的資質動態管理；指導全市建筑業企業轉型升級和對外市場開拓；承擔建筑企業參與國際工程承包和建筑勞務合作的協調工作；承擔住房和城鄉建設行業的外經工作；承擔建筑業行業統計和年度發展報告工作；負責出市建筑施工、監理企業的管理；指導全市建筑業企業創優奪牌工作。
（十二）建設工程消防監管科。負責本市行政區域內新建、擴建、改建（含室內外裝修、建筑保溫、用途變更）等建設工程的消防設計審查、驗收、備案及備案抽查工作；配合參與建設工程火災事故調查處理。
（十三）安全生產監管科。牽頭擬訂本部門、本行業落實安全生產責任制和相關法律法規的工作規劃；指導本部門、本行業安全生產綜合監管工作；組織開展本部門、本行業安全檢查和專項檢查；參與各類安全生產事故調查工作；綜合協調本部門、本行業安全生產工作等。